在污水生化处理的过程之中，污水中的碳源以及外加碳源能够为反硝化细菌提供碳源，如果能够直接利用污水中的有机碳作为碳源是比较经济的，这就要求污水中的bod值大于3~5，如果不满足这个要求的话，就需要额外再添加碳源，而常用的外加碳源，一般是甲醇，这是因为甲醇存在分解之后他所分解的主要产物是二氧化碳和水就不会出现残留一些难以降解的物质，更不会对环境有所污染，反而提高了反硝化反应的速率。
环境中的pH值是影响反硝化反应过程的一个重要的影响因素，反硝化菌他们比较适宜的生存ph在6.5到7.5之间，这时候进行反消化反应的速率是比较高。如果环境中的pH值并不在这个范围之内，那么反硝化反应的速率就会明显下降，因为这关系到反消化菌的活性反硝化细菌，它们大部分是异养兼性菌，只有在没有氧气的条件之下反硝化菌。
才会利用硝酸盐之中的氧气进行呼吸，使得大原子可以还原，如果在反应环境之中溶解氧气的浓度过高，那么分子氧就会成为供氧的物质，这样子反硝化细菌没有进行反消化反应，那么就会使得硝酸氮的还原反应受到了抑制。
反在硝化菌它可以在20摄氏度到40℃的环境之下大量繁殖，如果低于15℃，它们的活性就会降低，反消化速率就会明显的下降，所以在冬天比较低温的季节，为了可以维持反消化的速率，需要提高淤泥的停留时间，同时把负荷降低，提高污水的停留时间，这也是为了能够给反硝化细菌提供一个适宜的环境。
利用硝化作用和反硝化作用去除有机废水和高含量硝酸盐废水中的氮，来减少排入河流的氮污染和富营养化问题，已是很多人的共识。利用各种反应器处理城市的或其他废水时，有机废水中的碳源可支持反硝化作用，进行有效的生物脱氮。
污水处理中所利用的反硝化菌为异养菌，其生长速度很快，但是需要外部的有机碳源，在实际运行中，有时会添加少量甲醇等有机物以保证反硝化过程顺利进行。反硝化作用能造成氮肥的巨大损失，目前反硝化作用所损失的氮大约相当于生物和工业所固定的氮量，施用硝化抑制剂可收到良好的效果。